Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Spatc1Q148B6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Spatc1Q148B6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Spatc1Q148B6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Spatc1Q148B6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms