Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZUP1

Klrb1, Killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrb1Q0ZUP1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klrb1Q0ZUP1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klrb1Q0ZUP1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms