Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ttc39dQ0VF76 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Ttc39dQ0VF76 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Ttc39dQ0VF76 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Ttc39dQ0VF76 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Ttc39dQ0VF76 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Ttc39dQ0VF76 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Ttc39dQ0VF76 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Ttc39dQ0VF76 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Ttc39dQ0VF76 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Ttc39dQ0VF76 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Ttc39dQ0VF76 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39dQ0VF76 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms