Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms