Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms