Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms