Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms