Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RelaQ04207 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms