Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb5Q02739 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms