Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms