Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms