Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms