Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms