Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms