Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms