Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms