Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Ptprn2P80560 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Ptprn2P80560 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ptprn2P80560 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ptprn2P80560 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ptprn2P80560 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms