Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms