Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P58686 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P58686 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P58686 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
P58686 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
P58686 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P58686 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P58686 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P58686 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P58686 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P58686 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P58686 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P58686 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms