Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gsc2P56916 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gsc2P56916 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gsc2P56916 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gsc2P56916 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gsc2P56916 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gsc2P56916 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gsc2P56916 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gsc2P56916 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gsc2P56916 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gsc2P56916 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Gsc2P56916 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gsc2P56916 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gsc2P56916 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gsc2P56916 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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