Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cldn18P56857 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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