Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bace1P56818 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bace1P56818 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms