Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FmodP50608 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FmodP50608 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FmodP50608 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FmodP50608 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FmodP50608 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FmodP50608 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FmodP50608 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FmodP50608 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FmodP50608 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FmodP50608 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FmodP50608 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FmodP50608 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FmodP50608 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FmodP50608 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms