Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp3P49194 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp3P49194 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp3P49194 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp3P49194 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp3P49194 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp3P49194 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp3P49194 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp3P49194 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp3P49194 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp3P49194 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp3P49194 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms