Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms