Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms