Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms