Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BdnfP21237 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BdnfP21237 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BdnfP21237 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BdnfP21237 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BdnfP21237 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BdnfP21237 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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BdnfP21237 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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BdnfP21237 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BdnfP21237 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms