Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NefhP19246 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NefhP19246 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NefhP19246 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NefhP19246 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NefhP19246 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NefhP19246 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NefhP19246 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NefhP19246 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NefhP19246 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NefhP19246 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NefhP19246 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NefhP19246 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NefhP19246 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NefhP19246 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NefhP19246 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NefhP19246 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NefhP19246 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NefhP19246 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NefhP19246 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NefhP19246 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NefhP19246 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NefhP19246 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NefhP19246 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NefhP19246 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NefhP19246 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NefhP19246 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NefhP19246 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NefhP19246 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NefhP19246 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NefhP19246 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NefhP19246 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NefhP19246 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NefhP19246 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NefhP19246 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NefhP19246 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NefhP19246 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NefhP19246 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NefhP19246 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NefhP19246 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NefhP19246 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NefhP19246 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NefhP19246 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NefhP19246 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms