Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18524 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18524 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18524 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18524 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18524 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18524 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18524 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18524 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18524 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18524 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18524 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18524 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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