Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb1P12658 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb1P12658 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb1P12658 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb1P12658 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb1P12658 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb1P12658 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb1P12658 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms