Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DmdP11531 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DmdP11531 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DmdP11531 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DmdP11531 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DmdP11531 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DmdP11531 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DmdP11531 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DmdP11531 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DmdP11531 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DmdP11531 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DmdP11531 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DmdP11531 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DmdP11531 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DmdP11531 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DmdP11531 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DmdP11531 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DmdP11531 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DmdP11531 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DmdP11531 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DmdP11531 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DmdP11531 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DmdP11531 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DmdP11531 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DmdP11531 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DmdP11531 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DmdP11531 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DmdP11531 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DmdP11531 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DmdP11531 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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DmdP11531 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DmdP11531 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DmdP11531 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DmdP11531 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DmdP11531 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DmdP11531 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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DmdP11531 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DmdP11531 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DmdP11531 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DmdP11531 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DmdP11531 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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DmdP11531 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DmdP11531 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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DmdP11531 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DmdP11531 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DmdP11531 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DmdP11531 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DmdP11531 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DmdP11531 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DmdP11531 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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DmdP11531 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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DmdP11531 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DmdP11531 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DmdP11531 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DmdP11531 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DmdP11531 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DmdP11531 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DmdP11531 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DmdP11531 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DmdP11531 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DmdP11531 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DmdP11531 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DmdP11531 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DmdP11531 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DmdP11531 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DmdP11531 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DmdP11531 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DmdP11531 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms