Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd3P09027 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd3P09027 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms