Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gap43P06837 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms