Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoa4P06728 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoa4P06728 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoa4P06728 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa4P06728 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apoa4P06728 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa4P06728 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa4P06728 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apoa4P06728 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apoa4P06728 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apoa4P06728 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apoa4P06728 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa4P06728 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa4P06728 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa4P06728 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa4P06728 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa4P06728 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa4P06728 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa4P06728 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa4P06728 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa4P06728 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa4P06728 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa4P06728 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa4P06728 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa4P06728 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa4P06728 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa4P06728 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa4P06728 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa4P06728 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa4P06728 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa4P06728 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa4P06728 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa4P06728 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa4P06728 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa4P06728 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa4P06728 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa4P06728 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa4P06728 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa4P06728 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoa4P06728 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoa4P06728 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoa4P06728 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoa4P06728 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoa4P06728 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms