Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01878 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01878 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01878 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01878 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01878 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01878 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01878 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01878 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01878 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01878 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01878 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01878 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01878 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01878 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01878 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01878 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01878 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01878 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01878 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01878 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01878 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01878 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms