Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms