Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms