Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc1a6O35544 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc1a6O35544 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc1a6O35544 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc1a6O35544 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc1a6O35544 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms