Protein–RNA interactions for Protein: O35486

Crygs, Beta-crystallin S, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygsO35486 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrygsO35486 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrygsO35486 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms