Protein–RNA interactions for Protein: O35310

Hs3st1, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st1O35310 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms