Protein–RNA interactions for Protein: O09161

Casq2, Calsequestrin-2, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq2O09161 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq2O09161 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq2O09161 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casq2O09161 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casq2O09161 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq2O09161 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq2O09161 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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