Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
MsmbO08540 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MsmbO08540 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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