Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm3542K7N6U2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm3542K7N6U2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm3542K7N6U2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Gm3542K7N6U2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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Gm3542K7N6U2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm3542K7N6U2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm3542K7N6U2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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