Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms