Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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