Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms