Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms