Protein–RNA interactions for Protein: F6XDR3

Gm10542, Predicted gene 10542, mousemouse

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Length 90 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10542F6XDR3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10542F6XDR3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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