Protein–RNA interactions for Protein: F6TVX7

Gm20671, Predicted gene 20671 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20671F6TVX7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm20671F6TVX7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm20671F6TVX7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm20671F6TVX7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm20671F6TVX7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm20671F6TVX7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm20671F6TVX7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm20671F6TVX7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm20671F6TVX7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm20671F6TVX7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm20671F6TVX7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm20671F6TVX7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm20671F6TVX7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm20671F6TVX7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm20671F6TVX7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm20671F6TVX7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20671F6TVX7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms